晋江市口腔医院于2013年规划筹建，医院加挂“福建医科大学附属口腔医院闽南分院”牌子，是晋江市人民政府对接高端医疗资源的重要项目之一，是晋江市人民政府与福建省医科大学附属口腔医院的合作共建项目。医院坐落在晋江市青阳街道迎宾路25号(原晋江市计生局大楼)，是集医疗、培训教育、科研、牙病防治、健康为一体的公立非营利性三级口腔专科医院，将于2020年底整体投入使用。

　　医院总建筑面积约1.5万平方米，设置牙椅120张(I期开放60张)、床位50张。科室设置有口腔科(牙体牙髓病专业、牙周病专业、口腔粘膜病专业、儿童口腔专业、口腔颌面外科专业、口腔修复专业、口腔正畸专业、口腔种植专业、口腔麻醉专业、口腔颌面医学影像专业、口腔病理专业、预防口腔专业)、急诊医学科、医学检验科、病理科、医学影像科。

　　医院以建设高水平的闽南地区口腔精品专科为目标，建立“三大中心”(即：高层人才引进和培养中心、新技术研发和应用中心、疑难重症诊治中心)，积极创建福建医科大学口腔类别医学生实习基地和口腔类别住院医师规范化培训基地，为晋江周边乃至闽南地区广大群众及闽籍海外华侨提供专业口腔医学服务，促进晋江市口腔事业的健康持续发展。